Sars Coronavirus - diagnostiska analyser
Praktisk information
Allmänt
I början av 2003 blev världen varse en hittills okänd sjukdom kännetecknad av svår (ofta respiratorkrävande) lunginflammation med snabb spridning på vårdinrättningar. Den nya sjukdomen fick namnet svår akut respiratorisk sjukdom (sars) och på mycket kort tid kunde forskarvärlden identifiera ett ”nytt” virus, fastställa smittvägar och sätta in effektiva motåtgärder. Sars orsakas av ett tidigare helt okänt coronavirus. Genetiska studier har visat att sars-CoV på avgörande punkter skiljer sig från de tre tidigare kända coronavirusgrupperna, vilka hos människa normalt ger upphov till banala övre luftvägsinfektioner.
Mycket talar för att sars-CoV först nått människan från en hittills okänd smittreservoar bland vilda djur. De stora matmarknader med vilda djur som på senare år vuxit upp i södra Kina ger goda förutsättningar för överföring av sars-viruset och andra smittämnen från djur till människa.
Sjukdomen överförs vid tät kontakt mellan virusutsöndrande sjuk person och andra människor i dennes omgivning, och tidig rädsla för luftburen smitta har visat sig obefogad. De som insjuknat har i mycket hög utsträckning varit sjukhuspersonal som direkt vårdat sars-patienter eller familjekontakter till dessa. Detta mönster kan i undantagsfall brytas. En kombination av massiv virusutsöndring (hos personer med underliggande sjukdomar) och i övrigt maximalt ogynnsamma omständigheter har medfört att enstaka personer, s.k. ”super-spreaders” kunnat ge upphov till utbrott av varierande storlek. Det finns inget som tyder på att personer som bär på smittan utan att ha några symptom sprider sjukdomen vidare.
Indikation
Kriterier för svår akut respiratorisk sjukdom (sars) är den kliniska bilden med hastigt påkommande hög feber, ofta (i ca 75 procent av fallen) med frysningar och frossa, och
- vistelse inom tio dagar före insjuknandet i ett av WHO definierat område med aktuell lokal smittspridning av sjukdomen, eller nära kontakt med ett fall av sjukdomen inom tio dagar före insjuknandet.
I den kliniska bilden kan ingå - initialt eller efter hand - en rad andra symtom som
- hosta ca 60 procent,
- muskelvärk ca 60 procent,
- huvudvärk 20-55 procent,
- snuva ca 20 procent,
- ont i halsen ca 20 procent,
- andnöd ca 20 procent,
- yrsel 10-40 procent, och diarré (har rapporterats i varierande omfattning).
Inkubationstiden är vanligen 2–5 (upp till 10 dagar).
Kontakt
Provsvar: 08-457 25 73
Övriga frågor: 08-457 23 60
Metodfrågor: 08-457 25 73
Provtagning och transport
Lämpliga provtagningsmaterial för mikrobiologiska undersökningar är: Nasopharynxaspirat för elektronmikroskopi, PCR och cellodling. Feces, BAL-vätska, sputum, ögonsekret, blod och urin går också att analysera, främst med PCR. Akut och konvalescentserum skickas för antikroppspåvisning. Hantera alla kroppsvätskor som smittförande. Var särskilt försiktig vid arbetsmoment som kan ge upphov till stänk eller aerosol. Tänk på att inte utsätta övrig personal för smittrisk. Ytterligare information om provtagning finns på WHO SARS site som kan nås från SMI:s webbplats, se länkar i informationsrutan till högar.
Prov från patient skickas som diagnostiskt prov.
Kulturer från prov, som efter uppodling misstänks kunna vara ”sars-agens”, skickas som smittförande ämne till Smittskyddsinstitutet, se packa provet rätt.
Beställning av remiss:
Beställ/ladda ner SMI:s remiss
Priser:
För aktuella priser hänvisar vi till publikationen Prislista för speciell diagnostik
Information om analysen
Elektronmikroskopi, PCR och cellodling görs på inkommande adekvat tagna provmaterial. Akut och konvalescentprov (?10 dgr efter nyinsjuknande) krävs för antikroppspåvisning med IF-teknik.
Elektronmikroskopi besvaras
Coronavirusliknande partiklar påvisade/Coronavirusliknande partiklar ej påvisade. Detektion av viruspartiklar med elektronmikroskop kan inte skilja SARS Coronavirus från de tre Coronavirus typer som är kända sedan tidigare och som ger upphov till banala övre luftvägsinfektioner.
PCR- analys besvaras
SARS Coronavirus påvisas med PCR-teknik/ SARS Coronavirus påvisas ej med PCR-teknik. Analysen är specifik för SARS Coronavirus. Ingen korsreaktion med de kända Coronavirustyperna
Cellodlingsanalys besvaras
Vid odling på vävnadskultur påvisas SARS Coronavirus/Vid odling på vävnadskultur påvisas ej SARS Coronavirus. Cellkulturerna avläses var 3:e dag. Misstänkt cytopatogen effekt verifieras med immunofluorescensundersökning (IF) med SARS Coronavirus specifika antikroppar. Negativ odling avslutas efter 10 dagar.
Antikroppspåvisning med IF- teknik besvaras:
SARS Coronavirus IgG < 25 negativt. Vid antikroppstiter > 25 svaras: SARS Coronavirus IgG ”erhållen titer”
Ingen av analyserna har 100% sensitivitet för SARS-infektion och vid fortsatt misstanke om infektion vid negativt provsvar bör förnyade prover tas. Luftvägsprov (nasofarynxaspirat, BAL och sputum) taget mellan dag 7 och 14 efter insjuknandet innehåller mest virus och är sannolikt det material som ger säkrast diagnostik med PCR eller cellodling.
97% av sars-infekterade personer rapporteras ha antikroppar mätbara med IF-teknik 4 veckor efter insjuknandet.
Uppdaterad 2012-09-25 13:21
Fakta & fördjupning
Läs mer på andra webbplatser
AV Rutiner för hantering av prov från patienter med befarad Sars eller influensa A H5N1